يُعدّ فرع العقاقير في كلية الصيدلة بجامعة أوروك من الفروع الأساسية التي تُعنى بدراسة المصادر الطبيعية للأدوية، بما في ذلك النباتات الطبية، والكائنات البحرية، والميكروبات، بهدف استخلاص المركبات الفعالة وتطويرها لاستخدامها في العلاج. يهدف الفرع إلى تزويد الطلبة بالمعرفة المتقدمة حول التصنيف النباتي، والكيمياء العقاقيرية، وآليات تأثير المواد الفعالة بيولوجياً، إضافةً إلى دراسة طرق استخلاصها وتنقيتها وتحليلها باستخدام التقنيات الحديثة.

يتناول المنهاج الدراسي مختلف الجوانب المتعلقة بالطب التقليدي والبديل، مع التركيز على التطبيقات الصيدلانية للمستخلصات الطبيعية، ودراسة العوامل المؤثرة في جودة وفعالية المنتجات العشبية. كما يتم تدريب الطلبة على استخدام الأجهزة المتقدمة، مثل الكروماتوغرافيا الطيفية، في تحليل المركبات النشطة وتحديد بنيتها الكيميائية.

يُساهم الفرع في إعداد صيادلة مؤهلين للعمل في مجالات البحث والتطوير الدوائي، وصناعة المستحضرات العشبية، وتقييم السلامة والجودة للمنتجات الطبيعية، مما يُعزز من دورهم في تطوير الأدوية المستمدة من الطبيعة وفق الأسس العلمية الحديثة.